内墙防水耐水腻子的优点有很多，但就其标准来讲，单单满足耐水型标准的腻子产品也是有一些缺点和不足的。
    1、施工和打磨较费力。因为耐水腻子较结实，产品胶性大。耐水腻子的强度也要比非耐水腻子高，打磨时也会比较费力。
    2、产品上墙未干透前有碱性。耐水腻子要利用灰钙（主要成分有CaO，生石灰）遇水及二氧化碳的一系列复杂反应使自身的强度提高，这其中会产生有一定碱性的氢氧化钙，而且这种碱性一般要持续5-7天才会消失。可能使面层乳胶漆的色浆分解，导致颜色不均。 耐水腻子与普通腻子比，除耐水性能好以外主要有以下几方面特点：
    1）洁白细腻，手感好
    耐水腻子施工后表面光滑细腻，收光处理后的腻子会给人滑腻的手感， 具备装饰效果可作为装饰层。
    2）耐久性好、二次装修不用铲除
    3）节省涂料用量
    耐水腻子特有的白度和致密度，使其单位面积涂料附着力、遮盖率比使用普通腻子的墙体可节省25～30%的涂料用量。
    4）粘结强度高
    JG/T298-2010《建筑室内用腻子》标准对腻子的强度有了明确规定，普通腻子的标准状态粘结强度大于0.25MPa，对浸水后的强度没有要求，而耐水腻子要求标准状态粘结强度达到0.50MPa，浸水后的粘结强度大于0.30MPa。通过标准可以看出，耐水腻子的强度高于普通内墙腻子，因此使用耐水腻子不容易产生空鼓、脱落。
    5）单价高综合成本低
    耐水腻子单价是普通的1-2倍，这也是影响耐水腻子推广的一个因素，但使耐水腻子后的装饰效果是普通腻子远远达不到的。而且从涂料用量以及二次装修时的腻子的成本和施工费用综合计算，则使用耐水腻子成本低。